.eggs

######################
# Logs and databases #
######################
*\.log
.DS_Store


#############
# vim files #
#############
*\.swp
*~
\#*\#

################# 
# pycharm files #
#################
\.idea

##########################
# Python complied source #
##########################
*\.pyc
*\.pyo
build/
dist/
doc/_build/
MacSyLib.egg-info/

###########################
# coverage files
##########################
htmlcov/
.coverage
!/.github/workflows/.coverage
coverage_html/

###################################
# MacsyFinder results directories #
###################################
macsyfinder-*/
macsylib-*/

#################
# MacSyLib data #
#################
data/
!/tests/data
!/src/macsylib/data


###########################
# MacSyLib generated file #
###########################
MANIFEST
src/MacSyLib.egg-info
*\.idx


#############
# nextflow  #
#############
.nextflow/
.nextflow.log*
work/

########
# ruff #
########
.ruff_cache/

#########
# stuff #
#########
.ipynb_checkpoints
benchmark/
Conda/
Sandbox/
perf/